MapGene2Chrom基于Perl和SVG语言绘制基因物理图谱

• 作者: 刘贯山 吕婧 孔英珍 孙玉合 晁江涛 王倩 龚达平
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 物理图谱 基因分布图 SVG矢量图 作图 生物软件
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 91-97
• 页数: 7页
• 字数: 3759字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.2015.01.013

摘要

遗传图谱表现形式简洁明了，为分析遗传规律、克隆基因提供了便利。Gbrowse、MapViewer等工具虽然能够协助研究人员绘制相似形式的物理图谱，但有很大的局限性：(1)数据需提前布置好；(2)输出结果无法灵活修改。鉴于此，文章基于 Perl和 SVG语言，开发了一款生物辅助作图软件 MapGene2Chrom的本地版与网页版，该软件能够依据输入数据快速绘制相应的物理图谱。该软件输入数据格式简单，输出结果易于修改，图片格式为SVG矢量图，具有很好的移植性，以期为研究人员绘制物理图谱提供便利。