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茶尺蠖蜕皮激素受体基因Eo-EcR的克隆、生物信息学分析和表达检测
茶尺蠖蜕皮激素受体基因Eo-EcR的克隆、生物信息学分析和表达检测
作者:
吴光远
张辉
李慧玲
李良德
王定锋
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
茶尺蠖
蜕皮激素受体
克隆
生物信息学
时空表达
杀虫剂
摘要:
[目的]蜕皮激素受体(ecdysteroid receptor,EcR)是一种超家族核受体,它能与超气门蛋白USP组成异源二聚体复合物EcR/USP,调节20-羟基蜕皮酮(20E)的生物活性,进而调控昆虫的发育、变态及繁殖等生命过程.本研究旨在克隆茶尺蠖Ectropis obliqua Prout EcR基因全长,并了解该基因的编码蛋白特征和时空表达模式.[方法]通过RT-PCR方法并结合RACE技术,克隆茶尺蠖EcR的基因全长,通过生物信息学软件和在线网站分析茶尺蠖EcR的生物学特性,通过实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)技术比较茶尺蠖EcR在不同发育时期和6龄幼虫不同组织中的相对表达含量.[结果]克隆并鉴定了茶尺蠖EcR基因,将其命名为Eo-EcR(基因登录号:KP869130.1),Eo-EcR全长2 268 bp,含有1 728 bp开放阅读框,编码576个氨基酸.系统进化树和氨基酸同源性比对表明,Eo-EcR具有相对保守的进化特性,特别是与鳞翅目昆虫的保守性最高.三级结构模拟和功能结构域预测表明,Eo-EcR具有3个经典的结构模型,并以α螺旋为主,功能位点单一且为C4型锌指结构.qRT-PCR结果表明,Eo-EcR在5龄和6龄幼虫期以及成虫期表达量较高,在其他龄期表达量变化不大;同时在前胸腺表达量最高,在血淋巴表达量最低.[结论]明确了Eo-EcR的核苷酸序列及编码蛋白特征,明确了Eo-EcR的时空表达特性.该研究结果为进一步研究Eo-EcR的分子功能和基于Eo-EcR为靶标杀虫剂的研制奠定分子基础.
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篇名
茶尺蠖蜕皮激素受体基因Eo-EcR的克隆、生物信息学分析和表达检测
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
茶尺蠖
蜕皮激素受体
克隆
生物信息学
时空表达
杀虫剂
年,卷(期)
2015,(10)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
1063-1071
页数
分类号
Q966
字数
语种
中文
DOI
10.16380/j.kcxb.2015.10.004
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期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
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