中药三萜皂苷合成通路的生物信息学分析

• 作者: 侯林 崔清华 张召宝 潘晴 马鲁豫
• 来源期刊: 中成药
• 学科: 医学
• 关键词: 三萜皂苷 鲨烯合成酶 鲨烯环氧酶 2,3-氧化鲨烯环化酶
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 成分分析
• 页码范围: 1255-1261
• 页数: 7页
• 分类号: R284.1
• 字数: 4376字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-1528.2015.06.021

摘要

目的 从系统进化学角度对中药三萜皂苷合成通路中关键酶进行生物信息学分析.方法 从NCBI数据库下载已有17种中药中的鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质全长序列,通过生物信息学软件对其进行理化性质分析、保守域分析、蛋白质三维结构预测和系统进化树的构建.结果 序列分析表明,鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质序列保守性均较高.其中鲨烯合成酶具有两个高度保守的区域——富含天冬氨酸的镁离子结合位点1和2-可作为认定鲨烯合成酶的依据;鲨烯环氧酶和2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白三维结构保守,无规则卷曲部分为高变区.结论 上游合成在进化中趋于保守和稳定;三萜皂苷众多类型的形成可能与下游细胞色素P450、糖基转移酶、β-糖苷酶等的修饰有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马鲁豫		17	124	5.0	10.0
2	侯林	山东中医药大学药学院	63	214	9.0	12.0
3	崔清华	山东中医药大学药学院	46	154	7.0	11.0
4	张召宝	山东中医药大学药学院	3	26	2.0	3.0
5	潘晴	山东中医药大学药学院	3	26	2.0	3.0