玉米弯孢叶斑病菌RhoGAP基因家族的全基因组鉴定与生物信息学分析

• 作者: 侯巨梅 刘铜 左豫虎 王玉莹 申永强 赵丰舟
• 来源期刊: 玉米科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 RhoGAP 弯孢叶斑病菌 基因家族 基因结构
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·品种资源
• 页码范围: 44-49
• 页数: 6页
• 分类号: S513.035.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13597/j.cnki.maize.science.20150308

摘要

RhoGAPs(GTPase activating proteins)通过与RhoGTP酶结合,促使GTP酶水解成RhoGDP无活状态,在生物体中调控着重要的生物学功能.在全基因组上对玉米弯孢叶斑病菌(C.lunata)中RhoGAP基因家族成员进行鉴定,对其序列特征分析.结果表明,玉米弯孢叶斑病菌(C.lunata)有5个RhoGAP基因家族成员,分布在5不同的Scaffold上,其基因结构分析显示,外显子和内含子大小与位置均不一样,表现出复杂的基因结构.序列比对和系统进化分析发现,5个RhoGAP氨基酸序列与其他真菌来源的RhoGAP一样具有特征性保守序列区,与粗糙脉胞菌(N.crassa)和小麦黄斑叶斑病菌(P.tritici-repentis)的RhoGAP蛋白关系密切,其亲缘关系最近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	左豫虎		109	899	16.0	25.0
2	刘铜		23	73	5.0	8.0
3	侯巨梅		16	69	4.0	8.0
4	王玉莹		3	16	1.0	3.0
5	赵丰舟		5	6	2.0	2.0
6	申永强		3	9	1.0	3.0