草菇多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1的序列分析及其表达规律

• 作者: 丁宇斯 张磊 江玉姬 谢宝贵 谢斌 连玲丹 陈仁良 陶永新 黄千慧
• 来源期刊: 食用菌学报
• 关键词: 草菇 多糖单加氧酶基因 定量PCR 表达量
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 8-14,封3
• 页数: 8页
• 字数: 5627字
• 语种: 中文
• DOI: j.cnki/1005-9873.2015.01.002

摘要

依据草菇(Volvariella volvacea)基因组和转录组数据,采用ZOOM软件将转录组Reads定位到基因组的分析方法,从草菇中鉴定了一个多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1,对其进行生物信息学分析,并对其高效诱导物进行筛选,采用定量PCR方法研究其在降解稻草时表达量的变化规律.结果表明:草菇Vv-lpmo1基因DNA序列长1432 bp,有9个内含子,预测编码305个氨基酸的蛋白质;生物信息学分析表明该蛋白质有分泌信号肽,且含有两个完整的保守结构域:N端的glycoside hydrolase family 61 (GH61)结构域和C端的cellulose-binding domain(CBD)结构域.通过对葡萄糖、无碳源(饥饿诱导)、微晶纤维素、滤纸、稻草和木屑6种不同基质诱导草菇菌丝的定量PCR,结果筛选出稻草对Vv-lpmo1基因有最强的诱导作用.进一步研究稻草诱导不同时间的变化过程中,该基因的表达规律为0～4 h先下调;4～12 h恢复到初始水平;12 h以后开始迅速上调并维持较高水平.本研究表明草菇多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1属于诱导表达型基因,可能在草菇降解稻草基质中起着重要作用.