一种位点注释的蛋白质数据库用于磷酸化肽段的鉴定

• 作者: 叶明亮 王方军 程凯 边阳阳 邹汉法
• 来源期刊: 色谱
• 学科: 化学
• 关键词: 蛋白质组学 磷酸化 检索空间 位点注释
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 10-16
• 页数: 7页
• 分类号: O658
• 字数: 7306字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1123.2014.10019

摘要

磷酸化修饰的分析一直是蛋白质组学研究的热点之一。在鸟枪法的蛋白质组学研究中，通过在数据库检索中设定磷酸化为可变修饰可以直接鉴定磷酸化修饰的位点。但是翻译后修饰的引入会增加数据检索空间，造成鉴定灵敏度的降低。为了解决这一问题，我们构建了一种位点注释的数据库，这种数据库包含蛋白质的磷酸化位点信息，并开发了一种新的数据库检索策略用于磷酸化肽段的可靠鉴定。用不同类型的数据作为分析对象，通过Mascot检索软件对这种新的数据库检索策略进行了考察，证明了这种方法在保证鉴定结果可靠性的前提下提高了磷酸化肽段鉴定的灵敏度。