基于 Roche 454 GS FLX 的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发

• 作者: 姜云荣 张岩 张辉 潘婷 肖永双 高天翔
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: Roche 454 GS FLX 钝吻黄盖鲽 开发 微卫星标记
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 26-32
• 页数: 7页
• 分类号: S917
• 字数: 5097字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11758/yykxjz.20150104

摘要

利用 Roche 454 GS FLX 平台测序技术进行了钝吻黄盖鲽微卫星引物筛选，并采用聚类分析的方法对得到的5641个微卫星位点进行类比分析，得到247种多态性位点，其中完美型占52.22%，非完美型占20.24%，复合型占27.54%，(AC)n、(AG)n 两碱基重复类型的比例是44%，重复次数在10次以上的占总数的87.5%。随机选取11个位点的微卫星引物，采用5个野生个体，利用荧光标记和毛细管电泳进行多样性评价，4个位点偏离 Hardy-Weinberg 平衡，不同位点得到的等位基因范围为3?8，平均等位基因数为5.0。平均观望杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)及平均多态性信息含量(PIC)分别为0.588、0.788和0.670。结果表明，454 GS FLX 提供了一种直观、高效开发微卫星的方法。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张辉	中国科学院海洋研究所	195	2226	23.0	39.0
2	高天翔	中国海洋大学水产学院	154	2739	28.0	41.0
3	张岩	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	6	62	4.0	6.0
5	肖永双	中国科学院海洋研究所	7	52	4.0	7.0
6	姜云荣	上海海洋大学水产与生命学院	3	10	1.0	3.0
9	潘婷	上海海洋大学水产与生命学院	1	1	1.0	1.0