玉米耐盐基因ZmHKT1的序列变异分析

• 作者: 刘艳芝 姜志磊 姜昱 李毅丹 蒋超 金峰学
• 来源期刊: 玉米科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 ZmHKT1基因 单核苷酸多态性(SNP) InDel 连锁不平衡 单倍型
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·品种资源(吉林学术期刊栏目)
• 页码范围: 39-48
• 页数: 10页
• 分类号: S513.035.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13597/j.cnki.maize.science.20150508

摘要

HKT(High-affinity potassium transporter,高亲和性钾转运蛋白)基因所编码的蛋白能起到维持植物体内的Na+/ K+平衡的作用.在作物中HKT蛋白主要通过排出叶片中的Na+,从而提高植物耐盐性.对54份玉米自交系材料的ZmHKT1基因及上游序列进行多态性分析.结果表明,在3 784 bp的序列中,共有194个SNP和32个InDel.大部分变异集中在基因上游序列和内含子区,编码区的变异相对较少,说明编码区在进化和人工选择中承受了更大的选择压力.根据序列变异情况可将54份玉米自交系材料划分为15个单倍型,上游序列主要存在3种单倍型,而基因序列存在9种单倍型.遗传重组和连锁不平衡分析发现,全长序列只有3次重组事件发生,上游序列存在着非常强的连锁不平衡.