间充质干细胞与肝样转化细胞的基因谱差异分析

• 作者: 姜华 张志波 王丽昆 王辉 高建鹏
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 全基因组表达芯片 间充质干细胞 肝样细胞 GO分析 Pathway分析
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1078-1082
• 页数: 5页
• 分类号: R329.2
• 字数: 3525字
• 语种: 中文

摘要

目的 用全基因表达谱芯片筛选大鼠骨髓间充质干细胞(MSCs)与定向分化为肝细胞样细胞(HLCs)的表达基因差异并对其进行分析研究.方法 将大鼠MSCs诱导定向分化的肝样细胞做3次生物学重复,分别取MSCs和诱导分化的肝样细胞提取总RNA进行扩增,Cy3标记.与大鼠全基因表达谱芯片杂交,荧光扫描,筛选出差异表达基因,并进行GO分析和pathway分析.用实时定量PCR对结果进行验证.结果 芯片筛选结果显示,分化后的MSCs与HLCs间的差异表达的基因多达839个,其中上调表达448个,下调表达391个.在差异基因当中有生物学过程注释的基因有363个,具有细胞组分注释的差异基因有377个,具有分子功能注释的差异基因364个.Pathway分析结果中显示在差异基因参与的273个Pathway中有显著性变化的Pathway有45个,其中参与到显著性Pathway共有275个差异表达基因,其中上调基因122个,下调基因153个.通过差异基因构建基因调控网络,按照基因在网络的度(Degree)筛选出网络当中的5个关键基因:Pkm2、Nt5e、Fos、Adcy3、Itga7.结论 MSCs体外诱导定向分化为HLCs过程中,其调节的基因与肝细胞中细胞增殖、分化、凋亡、代谢和调控等密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜华	昆明医科大学附属延安医院消化内科	18	54	5.0	7.0
2	高建鹏	昆明医科大学附属延安医院消化内科	16	26	3.0	4.0
3	王辉	昆明医科大学附属延安医院消化内科	12	23	3.0	4.0
4	张志波	昆明医科大学附属延安医院消化内科	4	3	1.0	1.0
5	王丽昆	昆明医科大学附属延安医院消化内科	1	0	0.0	0.0