雷蒙德氏棉DnaJ蛋白的生物信息学预测及盐胁迫下的表达分析

• 作者: 刘静 张香桂 徐珍珍 徐鹏 沈新莲 郭琪
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: DnaJ蛋白 雷蒙德氏棉 旱地棉 克劳茨基棉 生物信息学 表达模式 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 391-400
• 页数: 10页
• 分类号: S562.035.3
• 字数: 4915字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201505002

摘要

DnaJ蛋白是一类很大的蛋白家族,是近年来研究较多的与胁迫反应等相关的蛋白.本文利用生物信息学手段,系统研究了雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii) DnaJ蛋白的数目、分类、染色体定位、亚细胞定位、进化以及在旱地棉(Gossypium aridum)和克劳茨基棉(G.klotzschianum)盐胁迫下的表达模式.结果显示:雷蒙德氏棉基因组有119个DnaJ蛋白,长度从73个氡基酸到2574个氡基酸不等;在13条染色体上不均匀分布,且具有不同的亚细胞定位;DnaJ结构域大致被分为9个小组,每个小组都有与拟南芥同源的基因;盐胁迫下,鉴定到旱地棉和克劳茨基棉共同差异表达的DnaJ基因3个,在旱地棉盐胁迫整个过程中差异表达的基因2个.雷蒙德氏棉DnaJ基因家族的鉴定和分析,将为进一步研究DnaJ基因家族的功能奠定一定的基础.