表皮生长因子受体基因突变临床检测方法学比较及其影响因素分析

• 作者: 冯云 吴荻 张志尚 沈胤晨 王帅 石远凯 钱晓燕 韩晓红
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 关键词: 肺肿瘤 表皮生长因子受体 基因突变 直接测序 楔形探针扩增阻滞突变系统
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 106-111
• 页数: 6页
• 字数: 5157字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2015.02.007

摘要

目的 比较临床常用的两种方法检测晚期非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体(EGFR)基因突变状态结果的差异,探讨福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片标本的不同保存方式对DNA数量、质量及对检测结果的影响.方法 收集中国医学科学院肿瘤医院2010年11月至2011年8月晚期NSCLC FFPE组织切片标本150份,分别采用楔形探针扩增阻滞突变系统(ScorpionsARMS)和直接测序法检测EGFR第18、19、20、21号外显子突变状态,分析两种方法检测EGFR基因突变结果的差异,对结果不一致病例收集临床治疗情况及生存数据并进行分析.对其中30份FFPE标本提取DNA并保存于-20℃3年,同样的30份FFPE标本按常规方法保存3年后再提取DNA,比较两种保存方式对DNA的数量、质量及对检测结果的影响.结果 Scorpions ARMS法检测EGFR基因突变的成功率(100％)高于直接测序法(87.3％),差异有统计学意义(x2=20.28,P＜0.05).两种方法检测EGFR基因突变的一致率为84.7％,一致性较好(Kappa=0.738,P＜0.001).分析结果不一致病例中5例接受靶向药物治疗后患者的生存情况,与ARMS检测结果一致性相对较好.新鲜FFPE标本提取并贮存于-20℃、3年的DNA与FFPE标本按常规方法保存3年后提取的DNA相比,后者质量相对较差,片段化程度更严重,但两种保存方法获取的DNA的EGFR基因突变检测结果均一致.结论 Scorpions ARMS与直接测序法联合检测结果更为全面、可靠.检测结果不确定的患者应以临床治疗及生存资料支持诊断.FFPE标本提取DNA后低温贮存,更有利于DNA完整性的保存.