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金针菇种质资源5个农艺性状与SSR标记的关联分析
金针菇种质资源5个农艺性状与SSR标记的关联分析
作者:
尚晓冬
张丹
王瑞娟
章炉军
谭琦
陆欢
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
金针菇
简单重复序列(SSR)
群体结构
连锁不平衡(LD)
关联分析
摘要:
金针菇(Flammulina velutipes)是一种重要的商业化栽培食用菌,为挖掘控制金针菇重要农艺性状的基因组区段,本研究以90份金针菇种质资源为实验材料,测定其原基期、菌柄直径、菌柄长度、菌盖直径和单瓶产量5个农艺性状,利用全基因组序列开发的95份多态简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)标记对供试材料进行基因组扫描,在分析实验材料的群体结构和连锁不平衡基础上,采用一般线性模型方法对5个农艺性状进行关联分析.结果表明,各供试材料的5个农艺性状均有极显著差异.95份多态SSR标记共检测到582个等位变异,平均每个位点的等位变异数为6.13个.标记多态信息含量(polymorphism information content,PIC)变化范围为0.204~0.818,平均为0.542.群体遗传结构分析将供试材料分为8个亚群体,群体内SSR位点间存在较高的连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD),不平衡程度D'值大于0.5的组合数占总组合数的33.01%.关联分析检测出28个标记与5个性状显著相关,其中原基期的关联标记有2个,菌柄直径的关联标记有12个,菌柄长度的关联标记有3个,菌盖直径的关联标记有9个,单瓶产量的关联标记有5个.关联SSR标记对表型变异解释率的变幅为5.11%~23.55%.研究表明,所选金针菇种质资源群体的遗传多样性以及连锁不平衡程度较高,适用于关联分析研究.本研究结果对金针菇核心种质资源库构建以及分子标记辅助育种具有参考价值.
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文献信息
篇名
金针菇种质资源5个农艺性状与SSR标记的关联分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
关键词
金针菇
简单重复序列(SSR)
群体结构
连锁不平衡(LD)
关联分析
年,卷(期)
2015,(1)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
96-106
页数
11页
分类号
字数
7316字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2015.01.011
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简单重复序列(SSR)
群体结构
连锁不平衡(LD)
关联分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
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