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真核生物FANCJ-like蛋白的结构与进化
真核生物FANCJ-like蛋白的结构与进化
作者:
吉克伍合
奚绪光
武泽峰
范三红
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
FANCJ-like蛋白
解旋酶
系统发育
保守模体
空间结构
摘要:
FANCJ-like蛋白是一类ATP依赖的5′-3′DNA解旋酶,参与DNA损伤修复、同源重组及G4-DNA拆解,在基因组稳定性维持过程中发挥重要功能。文章系统分析了47种真核生物的FANCJ-like蛋白,对其序列结构特征及起源进化进行了深入探讨。真核生物FANCJ-like蛋白包含4类成员——XPD、CHL1、RTEL1和FANCJ,但在真菌的一些世系及昆虫中存在严重缺失现象,如接合菌门(Zygomycota)缺失了 RTEL1,担子菌门(Basidiomycota)和子囊菌门(Ascomycota)缺失了 RTEL1和 FANCJ,双翅目昆虫缺失了 FANCJ。FANCJ-like 蛋白不仅包含经典解旋酶共有HD1和HD2结构域,而且在HD1结构域中插入了自身特有的Fe-S、Arch和Extra-D结构域。Fe-S和Arch结构域在4类成员中较保守,Extra-D结构域在XPD中不存在,在其他3类成员中也各不相同。在FANCJ-like蛋白的Fe-S、Arch和Extra-D结构域中分别发现了7个、10个和2个特有模体;除了已报道的保守模体外,HD1和HD2中分别发现了5个和12个特有模体。从这些特有模体的组成和排布来看, RTEL1和FANCJ最为相近,它们在HD2区包含两个独有模体Vb2和Vc,可能与其G4-DNA解旋活性相关。进化方面的证据表明,FANCJ-like蛋白起源于一种HD1区插入了Fe-S和Arch结构域的DNA解旋酶,在多细胞真核生物出现之前,该蛋白通过3次复制事件和随后的特异化过程,依次形成了目前真核生物所包含的4类FANCJ-like蛋白。
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文献信息
篇名
真核生物FANCJ-like蛋白的结构与进化
来源期刊
遗传
学科
关键词
FANCJ-like蛋白
解旋酶
系统发育
保守模体
空间结构
年,卷(期)
2015,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
204-213
页数
10页
分类号
字数
6283字
语种
中文
DOI
10.16288/j.yczz.14-115
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
奚绪光
西北农林科技大学生命科学学院
14
8
2.0
2.0
2
吉克伍合
西北农林科技大学生命科学学院
1
2
1.0
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武泽峰
西北农林科技大学生命科学学院
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传播情况
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二级引证文献(0)
2017(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
2018(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
FANCJ-like蛋白
解旋酶
系统发育
保守模体
空间结构
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
遗传
主办单位:
中国遗传学会
中国科学院遗传与发育生物学研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-9772
CN:
11-1913/R
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号院
邮发代号:
2-810
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
3898
总下载数(次)
19
总被引数(次)
79934
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