湖鲚体内与生长环境菌群 PCR－DGGE 指纹图谱及多样性分析

• 作者: 张勇 徐钢春 朱文龙 杜富宽 程起群 聂志娟 顾若波
• 来源期刊: 淡水渔业
• 学科: 农学
• 关键词: 湖鲚(Coilia ectenes taihuensis) PCR-DGGE 细菌群落 香农多样性指数
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 8-14
• 页数: 7页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4083字
• 语种: 中文

摘要

利用 PCR－DGGE 技术，选择细菌原核通用引物 F357－GC 和 R518对太湖湖鲚（Coilia ectenes taihuensis）鳃、肠壁及肠内容物及其生长环境菌群结构进行了初步分析。结果显示： PCR－DGGE指纹图谱分离显示49条清晰条带，样品菌群丰富度（DGGE 条带数）：湖水（33）＞肠道壁（23）＞湖泥（18）＞肠道内容物（16）＝鳃（16）；相应的香农多样性指数分别为：3．11、2．76、2．21、2．37、2．30。湖鲚肠道壁、肠道内容物和鳃与湖水分别具有14、14、10条共有带，切胶回收测定其中21条优势条带，主要包含：变形菌（Proteobacteria）、放线菌（Actinobacte－ria）、拟杆菌（Bacteroidetes）、柔膜菌（Tenericutes）、蓝藻细菌（Cyanobacteria）、厚壁菌（Firmicutes）。结果表明PCR－DGGE 指纹图谱能够清晰显示湖鲚不同部位及其生长环境细菌群落结构和区分其菌群结构差异，并阐明生长水域环境是影响湖鲚体内细菌菌群结构组成的主要因素之一。