甲型N9亚型流感病毒神经氨酸酶基因进化分析

• 作者: 万勇 汤华
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 流感病毒 神经氨酸酶 基因进化
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 139-144
• 页数: 6页
• 分类号: R373.1|R373.9
• 语种: 中文

摘要

通过对甲型N9亚型流感病毒神经氨酸酶(NA)核苷酸进化趋势的研究,进而探寻2013年新型H7N9亚型禽流感病毒产生的根源.本次研究选取美国国立生物技术信息中心(NCBI)的甲型N9亚型流感病毒的NA序列,采用生物软件ClustalX 2.0和MEGA 6.0建立进化树形图.对其欧亚分支,采用BEAST软件2.1.2和Datamonkey interface在线软件,计算和分析选择压力和进化速率.采用Bioedit软件对NA的氨基酸置换熵值计算并分析.系统进化树表明2013年新型H7N9亚型禽流感病毒可划分至现代欧亚分支之内,并且该分支的每位点每年核苷酸置换速率均值为3.8354×101,选择压力dN/dS均值为0.140413.16、19、40、53、81、84、11 2、256、335、359和401的氨基酸变异位点熵值＞0.5.研究分析表明2013年新型H7N9亚型禽流感病毒的NA片段基因可能来自甲型N9亚型流感病毒逐步进化的结果,最早可追溯到1996年的A/duck/Siberia/700/1996 (H11N9)流感毒株,新型H7N9亚型禽流感病毒来源不是来自外界环境压力引起突变的结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汤华		69	351	10.0	15.0
2	万勇		1	0	0.0	0.0