天祝白牦牛KAP1.1基因亚型B2A克隆及鉴定

• 作者: 吴晓云 张建一 张良斌 梁春年 潘和平 裴杰 褚敏 阎萍
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 B2A基因 KAP1.1蛋白 基因亚型
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 109-117
• 页数: 9页
• 分类号: Q78|S823.03
• 字数: 7026字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2015.01.018

摘要

通过对天祝白牦牛高硫角蛋白基因启动子B2A克隆得到其序列，将序列提交到NCBI，登录号：KJ910005，并对其进行生物信息学分析，通过亚细胞定位，磷酸化分析，二级、三级结构和保守结构域预测结果比较，MEGA 5．10软件进行NJ法进化树构建和MegAlign进行蛋白质相似分析来分析B2A基因与KAP1．1（Keratin associated protein1．1）基因的差异性。 B2A基因的CDS区全长为471 bp，共编码156个氨基酸，二级结构含有延伸链、β转角和无规卷曲3种。 B2A蛋白和KAP1．1蛋白的亚细胞定位，磷酸化分析，保守结构域，二级结构、三级结构和同源性差异较大。但是从功能预测结果显示2个蛋白功能完全一致，并且使用Clustal X进行氨基酸序列比对分析显示B2A蛋白从第33位开始相对于KA1．1蛋白有10个氨基酸的缺失以外，其余序列之间的保守性相当高。因此，可以证明B2A基因是KAP1．1基因的基因亚型。