外周全血中与老化相关的DNA甲基化标记的来源

• 作者: 李红东 洪贵妮 郭政
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 外周全血 老化 DNA甲基化 CD4+T细胞 CD14+单核细胞
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 165-173
• 页数: 9页
• 字数: 6750字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.14-394

摘要

机体老化与癌症、神经退行性疾病等许多复杂疾病相关。目前，研究者已在外周全血中识别了大量的与老化相关的DNA甲基化标记，这些标记可能反映外周血白细胞在机体老化过程中发生的变化，也可能反映外周血中与年龄相关的细胞构成比例的变化。文章利用3组正常个体外周全血 DNA 甲基化谱，采用 Spearman秩相关分析识别了与老化相关的CpG甲基化位点(age-related DNA methylation CpG sites, arCpGs)并评价了其可重复性；利用去卷积算法估计了各外周血样本中髓性和淋巴性细胞的比例并分析了其与年龄的相关性；比较了在外周全血、CD4+T细胞和CD14+单核细胞中识别的arCpGs的一致性。结果显示，在独立外周全血数据中识别的arCpGs具有显著的可重复性(超几何检验，P=1.65×10?11)。外周血髓性和淋巴性细胞的比例分别与年龄显著正、负相关(Spearman秩相关检验，P<0.05，r≤0.22)，它们间DNA甲基化水平差异较大的CpG位点倾向于在外周全血中被识别为 arCpGs。在 CD4+T细胞中识别的 arCpGs与在外周全血中识别的 arCpGs显著交叠(超几何检验，P=6.14×10?12)，且99.1%的交叠位点在 CD4+T细胞及外周全血中的 DNA甲基化水平与年龄的正、负相关性一致。尽管在 CD14+单核细胞中识别的 arCpGs 与在外周全血中识别的 arCpGs 并不显著交叠，但是在交叠的51个arCpGs中，有90.1%的位点在 CD14+单核细胞、外周全血以及CD4+T细胞中的 DNA甲基化水平与年龄的正、负相关性一致，提示它们可能主要反映细胞间共同的改变。在外周全血中识别的 arCpGs 主要反映某些白细胞共同或特异的DNA甲基化改变，但是也有一部分反映外周血细胞比例构成的变化。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭政	电子科技大学生命科学与技术学院	9	10	2.0	2.0
3	李红东	电子科技大学生命科学与技术学院	3	8	2.0	2.0
4	洪贵妮	电子科技大学生命科学与技术学院	3	7	2.0	2.0