BCESCP：基于多类支持向量机的B细胞表位亚类分类研究

• 作者: 练瑶 葛猛 黄泽炽
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 医学
• 关键词: 多类支持向量机 B 细胞表位多类亚类 预测服务器
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 455-459
• 页数: 5页
• 分类号: R392.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2015.05.010

摘要

目的：根据诱导的特异性抗体种型，B 细胞表位被分成不同的亚类。探索表位多类亚类之间的区别非常重要，能促进揭示免疫系统为什么会针对不同的表位产生特异性抗体应答。基于多类支持向量机，发展一个能区分多类表位亚类并且能预测 B 细胞表位的亚类类别的模型。方法：训练模型的数据集来源于免疫表位数据库，数据集包含4类数据，对应4种 B 细胞表位亚类：IgA 表位，IgE 表位，IgG 表位以及 IgM表位。通过5折交叉验证，分别探索氨基酸组成特征，quasi-序列顺序特征以及二肽组成特征区分表位多类亚类的能力。结果：实验结果表明二肽组成特征的区分性能最好，整体准确率为61．58％，应用此多类分类模型，开发了一个名为BCESCP 的免费使用的 B 细胞表位的亚类类别预测服务器，BCESCP 可以通过如下地址访问：http：／／www．bioin-fo．tsinghua．edu．cn ／epitope ／BCESCP／。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	练瑶	清华大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
2	黄泽炽	清华大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
3	葛猛	清华大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0