绒泡菌目黏菌的ITS1-5.8S-ITS2二级结构的比较分析

• 作者: 李倩 闫淑珍 陈双林
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 绒泡菌目 ITS RNA二级结构 模型 互补性碱基变化 分子进化
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 235-245
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.130224

摘要

为探讨核糖体DNA转录间隔区(rDNA ITS)的RNA二级结构在黏菌系统发育研究中的作用,以黏菌ITS通用引物PHYS4和PHYS5对绒泡菌目5属8种黏菌的rDNA ITS进行扩增和测序,利用RNA structure构建了ITS区的RNA二级结构模型.结果表明:ITS1在绒泡菌目黏菌中不能形成一个紧实的结构,但大部分物种都具有一段稳定的螺旋结构,可能对rRNA的成熟具有作用;5.8S rRNA的二级结构相似,由4个螺旋组成,主要为两种类型;基于5.8S rRNA和28S rRNA相互作用构建的ITS2的二级结构模型显示,它由一个封闭的多分支环和至少4个主要的螺旋组成,其中螺旋Ⅳ结构相对比较保守.由于ITS区的二级结构相比核苷酸序列更加保守,因此深入地分析其二级结构有助于认识其结构与进化的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈双林	南京师范大学生命科学学院	71	771	13.0	24.0
2	闫淑珍	南京师范大学生命科学学院	46	471	12.0	20.0
3	李倩	南京师范大学生命科学学院	37	89	5.0	9.0