不同海拔血满草居群cpDNA psbA-trnH序列特征及其遗传结构

• 作者: 刘瑞 卢志敏 杨青松 熊勇 胡琳 赵艳
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 遗传多样性 民族药 接骨木属 DNA条形码
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 337-342,408
• 页数: 7页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2015.04.0069

摘要

[目的]针对云南常用民族药血满草遗传背景研究少的现状,利用叶绿体DNA分析血满草遗传多样性和遗传背景.[方法]采集5个不同海拔分布的野生血满草居群,通过PCR技术扩增psbA-trnH序列并测序,然后利用生物学软件分析序列特征以及不同野生居群遗传多样性.[结果]血满草psbA-trnH序列长度范围在487～530 bp之间,GC含量为29.12～30.17％.Bioedit软件排列比对后长度为485 bp,其中有45个信息位点,包括1个单碱基缺失、15个点突变、29个同源信息位点.根据该序列,DnaSP软件分析表明血满草多样性(pi)为0.02004,平均变异数目为9.019,构成27个单倍型,单倍型多样性为0.997.其中居群1(海拔3 343 m)多样性最高,其次是居群3(海拔3 554m),再次是居群5(海拔3 790 m),最小的为居群2(海拔3445 m).居群间的遗传分化系数在0.～0.089之间,居群间的遗传距离在0.013～0.022之间.[结论]不同海拔血满草居群之间遗传分化不明显,远低于异交生物平均水平.另外,谱系分析也表明血满草不同居群之间的系统关系不清晰,与地理分布和海拔分布的关系不明显.该结果可能与血满草为克隆繁殖、高适应能力、种子传播范围广等生活史策略相关.同时也可能是psbA-trnH序列在居群水平上分辨率不够造成.