婚内性传播的 HIV 准种传播和进化规律研究

• 作者: 张静娜 段松 温玉洁 潘品良 王继宝 蒋岩 赵琦 高志云 龚渝蓉
• 来源期刊: 中国艾滋病性病
• 学科: 医学
• 关键词: 艾滋病病毒 分子流行病学 疾病传播 高通量测序 准种
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 376-380
• 页数: 5页
• 分类号: R512.91|R373.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.13419/j.cnki.aids.2015.05.08

摘要

目的 研究婚内性传播的艾滋病病毒(HIV)准种传播和进化规律,并探讨样本类型(全血、血浆)对分析结果的潜在影响.方法 选择传播关系和传播时间明确的4对婚内新近传播HIV夫妻作为研究对象,采集血液样本,分别提取全血、血浆中的总核酸、核糖核酸(RNA),进行HIV基因亚型分析.以HIV-1包膜蛋白(env)基因区为目的片段,分别将总核酸或RNA反转录产物进行巢式聚合酶链反应(PCR)扩增,构建脱氧核糖核酸(DNA)文库,Miseq高通量测序,分析HIV准种分布,计算样本内、夫妻样本间的基因离散率,并做系统进化树分析.结果 4对夫妻的HIV基因亚型分别相同.除1对夫妻的血浆样本PCR扩增失败外,其余14份全血、血浆样本成功进行Miseq测序,获得134 135(67 831～178 392)条有效序列,代表101(12～455)个独特准种.多数样本中前20个准种序列的频数占总序列数的比例＞80％;6/8的受检者全血样本中,第1个优势序列的频数占了90％以上;同一受检者全血样本中高频准种的分布比血浆中更集中.基因离散率、系统进化树分析结果显示,4对夫妻的婚内HIV传播关系都与预期相符,传播方向除1份血浆样本外同样与预期相符.结论 HIV准种的多样性和频数分布有助于了解HIV的传播和进化规律,全血样本所得的HIV感染溯源分析结果比血浆样本更可靠、更实用.