隆林山羊ACSS2基因的克隆及序列分析

• 作者: 史怀平 周恒 张彩珠 曹艳红 朱江江 莫柳忠
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 隆林山羊 ACSS2 肌间脂肪
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 12-16
• 页数: 5页
• 分类号: S811.6
• 字数: 3421字
• 语种: 中文

摘要

根据藏系绵羊的ACSS2基因序列设计克隆引物,并以隆林山羊肌间脂肪组织为模板克隆ACSS2基因并测序.利用在线生物信息学软件分析ACSS2蛋白的序列特性,分析不同物种间ACSS2基因的进化关系及三级结构,从而预测隆林山羊ACSS2基因的功能.结果发现,隆林山羊ACSS2基因CDS全长2 103 bp,由18个外显子组成,编码701个氨基酸残基.与牛(NM_001105339)、人(NM_018677)、绵羊(XM_012114899)、小鼠(NM_019811)序列的ACSS2基因相比较,核苷酸相似性分别为97.9％、91.5％、97.6％和88.2％,氨基酸的相似度分别为98.4％、93.6％、97.4％和91.9％.其中绵羊较山羊多出13个氨基酸(G279-Q291,GKPKEKPKHIRPQ).隆林山羊ACSS2蛋白与其他物种间具有相似的三级结构系统,且与绵羊和牛具有较近的亲缘关系,而与猪的亲缘关系较远.