北京市丰台区2012年污水中埃可病毒6型分离株VP1区的基因特征分析

• 作者: 尉秀霞 张勇 李晓嫘 李洁 杨军勇 祝双利 秦萌 胡岚 董晓根
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 埃可病毒6型 环境监测 VP1编码区 基因特征
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 104-108
• 页数: 5页
• 分类号: R372.2+3
• 语种: 中文

摘要

目的 了解北京市丰台区污水中埃可病毒6型(echovirus 6,ECHO6)的基因特征.方法 选择吴家村污水处理厂为监测点,2012年1～12月,每月采集监测点污水进行肠道病毒(enterovirus,EV)分离和鉴定,并对分离到的ECHO6进行VP1编码区核苷酸序列测定和分析.结果 在吴家村污水处理厂监测点,共分离到64株病毒,其中ECHO6病毒12株,在非脊髓灰质炎(脊灰)肠道病毒(non-poliomyelitis entero-viruses,NPEV)分离株中比例最高.选择10株ECHO6进行VP1编码区核苷酸序列分析,结果表明10株病毒的VP1区核苷酸同源性为92.9％～100.0％,与D5基因型代表株的VP1区核苷酸同源性最高,为88.7％～94.2％.进化树分析结果显示,北京市丰台区ECHO6分离株与D5基因型代表株处于同一分支,并在D5进化分支的不同簇中.结论 北京市丰台区污水中ECHO6分离株为D5基因型并在D5进化分支的不同簇中,并为丰台区人群肠道病毒的监测提供重要的补充信息.