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摘要:
利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends, RACE)克隆了大珠母贝CCT-eta cDNA全长。利用多种生物信息学软件对大珠母贝CCT-eta cDNA和预测的氨基酸序列进行了分析,并采用实时荧光定量PCR对其组织表达谱和冷应激下的表达模式进行了分析。结果显示,大珠母贝CCT-eta cDNA全长为1895bp,其中开放阅读框(ORF)为1632bp,编码543个氨基酸残基,含有CCT家族的3个签名序列:37RTTLGPRGMDKLI49、58ISNDGATILKTLDIVHP74、86QDAEVGDGT94,具有3个保守的功能结构域:赤道结构域、顶端结构域和中间结构域。氨基酸同源序列比对结果显示,大珠母贝CCT-eta与其他物种的同源性较高,与长牡蛎(Crassostrea gigas)、斑马鱼(Danio rerio)、人(Homo sapiens)的同源性分别为83.2%、80.1%、79.3%。CCT-eta基因在大珠母贝各组织中均有表达,但在闭壳肌中表达水平最高,而在心脏和肝胰腺中表达很低;冷应激后,大珠母贝各组织中CCT-eta表达显著上调,但不同组织的冷应激响应模式不同,闭壳肌响应速度较慢,而心脏和肝胰腺响应速度较快,提示冷应激时CCT-eta对保护大珠母贝肝胰腺和心脏等内脏组织具有重要作用。
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文献信息
篇名 大珠母贝CCT-eta基因cDNA克隆及其冷应激表达
来源期刊 热带海洋学报 学科
关键词 大珠母贝 CCT-eta cDNA 组织表达 冷应激
年,卷(期) 2015,(6) 所属期刊栏目 海洋生物学
研究方向 页码范围 57-63
页数 7页 分类号 Q785|Q786|S968.31+6.3
字数 语种 中文
DOI 10.11978/2015021
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘志刚 广东海洋大学水产学院 95 1148 21.0 29.0
2 毛艾涛 广东海洋大学水产学院 1 1 1.0 1.0
3 唐啸尘 广东海洋大学水产学院 8 46 4.0 6.0
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期刊影响力
热带海洋学报
双月刊
1009-5470
44-1500/P
大16开
1982-01-01
chi
出版文献量(篇)
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