软刺裸鲤和齐口裂鳆鱼HIF1 B和HIF2 A的克隆及低氧适应性的表达分析

• 作者: 姜华鹏 张驰 王丛丛 许强华
• 来源期刊: 淡水渔业
• 学科: 农学
• 关键词: 裂腹鱼类 低氧环境 HIF1B HIF2A 基因克隆 进化
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 11-18
• 页数: 8页
• 分类号: S917.4
• 字数: 5384字
• 语种: 中文

摘要

获得高原软刺裸鲤(Gymnocypris dobula)和齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)HIF1B和HIF2A基因cDNA完整的开放阅读框(ORF), 并进行氨基酸序列分析; 采用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术, 检测了 HIF1B和HIF2A在两种裂腹鱼体内各组织中的表达, 以及应激性低氧条件下罗非鱼不同组织中的表达. 基因序列分析结果显示,软刺裸鲤和齐口裂腹鱼HIF1B基因长度分别为2 322 bp和2 313 bp, 预测编码773和770个氨基酸; HIF2A基因长度分别为2 466 bp和2 502 bp, 预测编码821和833个氨基酸. 同源分析显示, 齐口裂腹鱼和软刺裸鲤HIF1B ODD结构域氨基酸序列同源性为93. 12%, HIF2A为89. 56%. 在CODD保守结构域中,软刺裸鲤HIF1B的Lxx-LAP位点突变成PxxLAP,这可能是高原裂腹鱼HIF1B功能进化的重要标志. 定量检测结果表明,在应激性低氧环境中,硬骨鱼类鳃和皮肤中HIF1B和HIF2A mRNA的表达上升;而在长期低氧环境中,硬骨鱼类鳃和皮肤中HIF1B和HIF2A mRNA的表达下降,推测硬骨鱼体内可能存在两种不同的机制来适应长期低氧和应激性低氧环境.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许强华	上海海洋大学海洋科学学院	23	150	6.0	12.0
9	王丛丛	上海海洋大学海洋科学学院	14	37	3.0	5.0
15	姜华鹏	上海海洋大学海洋科学学院	3	19	2.0	3.0
22	张驰	上海海洋大学海洋科学学院	3	7	1.0	2.0