[目的]对比分析新疆与塔吉克斯坦帕米尔高原植物区系,为帕米尔高原地区生物多样性保护,改善其生态环境及阐明世界帕米尔高原地区植物区系提供科学依据.[方法]查阅《新疆植物志》、《Flora of China》、《塔吉克斯坦植物志》等植物志,统计分析新疆与塔吉克斯坦帕米尔高原植物各自特点.[结果]新疆帕米尔高原种子植物共54科274属846种,塔吉克斯坦帕米尔高原种子植物共79科491属2 420种.植物区系科属水平上,两区都呈现出单种属、寡种属占极高的比例,塔吉克斯坦帕米尔高原区植物区系组成更为复杂.[结论]塔吉克斯坦帕米尔区科属数量明显大于新疆帕米尔区高原,植物区系对比除世界广布外都以温带成分为主.