辣椒组蛋白去乙酰化基因家族分离鉴定及表达分析

• 作者: 徐小万 李植良 李涛 李颖 王恒明 黎振兴
• 来源期刊: 辣椒杂志
• 关键词: 辣椒 组蛋白去乙酰化 生物信息学分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 字数: 2991字
• 语种: 中文

摘要

组蛋白去乙酰化在基因表达调控方面扮演重要角色,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用.在基因组范围内,利用生物信息学方法对辣椒的组蛋白去乙酰化(HDAC)基因家族的各成员、分布及结构和功能等进行分析.预测结果显示辣椒HDAC家族包含14个蛋白质,分为3个亚族,其中RPD3/HDA1成员最多,为10个;HD2具有3个成员,SRT2仅有1个成员;其主要分布在8个染色体上,且进化分析结果表明辣椒HDAC基因成员与拟南芥家族具有相似分类.在辣椒HDAC结构域中包含18个重要的基序,同组中的HDAC成员蛋白序列的氨基酸保守结构域基本一致,且各亚族成员的氨基酸保守结构域组成特异,表明这些基序的存在对HDAC蛋白功能的执行是必需的.分析辣椒发育过程中HDAC各成员表达谱数据发现,CaHDA1在果皮和胎座成熟过程中表达量逐渐升高,说明该基因可能参与了辣椒后期果实的发育过程.这将为辣椒HDAC家族基因的深入研究和功能解析提供实验参考依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李颖	广东省农业科学院蔬菜研究所	69	838	13.0	27.0
2	王恒明	广东省农业科学院蔬菜研究所	58	656	12.0	24.0
3	徐小万	广东省农业科学院蔬菜研究所	44	281	8.0	14.0
4	黎振兴	广东省农业科学院蔬菜研究所	45	392	9.0	18.0
5	李植良	广东省农业科学院蔬菜研究所	45	451	11.0	19.0
6	李涛	广东省农业科学院蔬菜研究所	21	79	5.0	8.0