DDRT-PCR技术分析籽粒苋镉胁迫下相关基因的差异表达

• 作者: 吴琦 唐自钟 孙蓉 张世熔 晋海军 胡洪利 陈惠
• 来源期刊: 农业环境科学学报
• 关键词: 籽粒苋 镉胁迫 DDRT-PCR技术
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 污染生态
• 页码范围: 1659-1664
• 页数: 6页
• 分类号: X171.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.11654/jaes.2015.09.005

摘要

以镉污染修复植物籽粒苋（Amaranthus hypochondriacus）的根、叶、果为实验材料，利用DDRT-PCR技术分析籽粒苋Cd胁迫下基因表达水平的变化。结果表明：回收差异片段获得镉处理诱导的4个差异表达序列（EST-1、EST-2、EST-3和EST-4），经Blastn比对，EST-1与土人参26S核糖体RNA基因部分序列（GB|HQ843466.1）一致性为99％，EST-2与虎耳草26S核糖体RNA大亚基基因部分序列（GB|AF036498.1）一致性为93％，EST-3与大肠杆菌菌株TW 14359 DNA聚合酶Ⅲα亚基基因（ECs0186）完整CDS（GB|EU906049.1）一致性为97％，EST-4与米曲霉RIB40β-葡萄糖苷酶基因（XM 001816779.2）一致性为99％；经Blastx比对， EST-1与假定蛋白MTR 5g051030[苜蓿]（XP 003614386.1）氨基酸序列相似性为26％，EST-2与假定衰老相关蛋白[柏杉]（GB|ACA30301.1）氨基酸序列一致性为98％，EST-3与DNA聚合酶Ⅲα亚基[大肠杆菌OP50]（ZP 06935700.1）氨基酸序列一致性为100％，EST-4与β-葡萄糖苷酶[黄曲霉NRRL3357]（XP 002383240.1）氨基酸序列一致性为99％；4个差异表达基因通过调控蛋白质代谢、DNA复制和糖代谢等途径来应答镉胁迫。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴琦	四川农业大学生命科学学院	109	1300	21.0	31.0
2	陈惠	四川农业大学生命科学学院	108	1021	19.0	26.0
3	张世熔	四川农业大学环境学院	175	3217	30.0	50.0
4	唐自钟	四川农业大学生命科学学院	27	59	4.0	6.0
5	孙蓉	四川农业大学生命科学学院	16	40	4.0	6.0
6	胡洪利	四川农业大学生命科学学院	4	21	3.0	4.0
7	晋海军	四川农业大学生命科学学院	5	3	1.0	1.0