膀胱尿路上皮癌组织lincRNA差异表达及机制探讨

• 作者: 何旺 林天歆 王沛 钟广正 黄健
• 来源期刊: 中华肿瘤防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 膀胱肿瘤 长链基因间非编码RNA PRC2复合物 RNA-蛋白质相互作用
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 实验研究/论著
• 页码范围: 421-426
• 分类号: R737.14
• 语种: 中文

摘要

目的 筛选膀胱尿路上皮癌与癌旁组织中差异表达长链基因间非编码RNA(long intergenic noncoding RNA,lincRNA),并探讨其可能作用机制.方法 收集2011-01-04-2011-02-18中山大学孙逸仙纪念医院泌尿外科4例膀胱尿路上皮癌与癌旁组织标本并应用Trizol提取总RNA,应用基因芯片筛选差异表达的lincRNAs及mRNAs,应用生物信息学分析差异表达lincRNAs和mRNAs特征,应用EZH2抗体和SUZ12抗体进行RNA免疫沉淀筛选与多梳抑制复合物2 (PRC2)相互作用的lincRNAs.结果 基因芯片筛选发现,共376个lincRNAs及1 284个mRNAs在膀胱尿路上皮癌组织与癌旁组织中存在表达差异(差异倍数≥2.0倍,P＜0.05).lincRNAs表达异常在第1、2、7号染色体最常见,mRNAs差异表达基因的信号通路分析显示,参与细胞间黏附、钙离子信号通路、MAPK信号通路和细胞因子间受体相互作用的基因改变最为明显.与非免疫血清IgG组相比,应用EZH2抗体和SUZ12抗体进行的RNA免疫沉淀提示,HOTAIR分别富集(11.2±1.7)和(9.6±1.1)倍,BX640973分别富集(36.3±2.1)和(14.7±0.8)倍,NR_024344分别富集(30.2±3.5)和(7.7±1.2)倍,LINC312分别富集(5.1±0.4)和(5.7±0.5)倍,NR_036444分别富集(29.5±1.8)和(11.2±0.6)倍,MALAT1分别富集(12.9±1.6)和(25.1±1.5)倍,MEG3分别富集(13.2±0.6)和(4.0±1.3)倍,差异均有统计学意义,P值均＜0.05.结论 膀胱癌中大量lincRNAs和mRNAs表达发生改变,部分lincRNAs通过与PRC2复合物相互作用发挥功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄健	中山大学孙逸仙纪念医院泌尿外科	160	811	12.0	18.0
2	林天歆	中山大学孙逸仙纪念医院泌尿外科	68	404	10.0	15.0
3	何旺	中山大学孙逸仙纪念医院泌尿外科	5	13	2.0	3.0
4	王沛	中山大学孙逸仙纪念医院泌尿外科	3	5	1.0	2.0
5	钟广正	中山大学孙逸仙纪念医院泌尿外科	3	13	2.0	3.0