人类基因组DNA甲基化数据分析的研究现状

• 作者: 凡时财 李承哲 裴云飞
• 来源期刊: 中国科学（生命科学）
• 关键词: DNA甲基化 检测技术 预测方法 差异甲基化 CpG岛
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 评述
• 页码范围: 450-459
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/N052015-00009

摘要

作为人类基因组最为典型的表观遗传现象,DNA甲基化在多种关键生理活动中扮演重要角色.系统分析基因组尺度的DNA甲基化概况意义重大.从CpG岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法;重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势;并对DNA差异甲基化在组织特异性、癌症等多种疾病中的计算分析进行了全面的综述.