河川沙塘鳢线粒体基因组重排机制及分子标记筛选

• 作者: 刘至治 李强 顾珈宁
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 河川沙塘鳢 线粒体基因组 基因重排 分子标记
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 858-866
• 页数: 9页
• 分类号: Q959
• 字数: 5348字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2015.14484

摘要

采用引物步移法PCR扩增，获得全长为16846 bp 的河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)线粒体全基因组DNA (mtDNA)，并对其基因结构、重排机制及在系统发育中的应用进行了分析。研究结果：(1)河川沙塘鳢mtDNA由37个基因和1个非编码控制区组成；除 ND6和8个 tRNA 外，其他基因都编码在重链(H)上； tRNA 基因因发生滑移重排(shuffling)，将经典的线粒体基因组 HSL (tRNAHis–tRNASer–tRNALeu)排列变成了 SLH (tRNASer–tRNALeu–tRNAHis)排列，造成在tRNALeu与tRNAHis、ND4与tRNASer之间分别插入了320 bp和42 bp的两个“匿名区”。(2)检测的112种鲈形目(Perciformes)鱼类中，仅有13种(11.61%)发生了mtDNA基因重排现象，而沙塘鳢属的中华沙塘鳢(O. sinensis)、平头沙塘鳢(O. platycephala)与河川沙塘鳢的基因重排位置一致，揭示其可能是沙塘鳢属鱼类进化过程中的一个重要分子“标签”。(3)筛选得到的两个分子标记ND4和ND5基因，适合用于虾虎鱼亚目(Gobioidei)鱼类科阶元水平的系统发育关系的重建。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘至治	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	15	109	6.0	10.0
2	李强	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	5	17	3.0	4.0
3	顾珈宁	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	1	5	1.0	1.0