与草菇子实体形成和开伞相关的vv-exp基因的克隆及表达分析

• 作者: 严俊杰 卢园萍 王威 谢宝贵 谢斌 连玲丹 郭丽(石羡)
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 菌丝 原基 食用真菌 纽扣期 转录组
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 717-723
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.150088

摘要

利用本地Blast,将灰盖鬼伞的高速泳动族蛋白(high-mobility-group box,HMGB)编码基因exp与草菇PYd21基因组进行比对,找到一个exp的同源基因vv-exp.克隆测序PYd21与PYd15两单孢菌株中vv-exp基因并进行比对,结果表明2个菌株的vv-exp基因序列一致.结合本实验室草菇转录组数据对vv-exp基因结构进行分析,结果显示此基因全长为1 937bp,共含3个内含子;开放阅读框长度为1 773bp,编码590个氨基酸.预测的氨基酸序列生物信息学分析结果表明,此基因编码的蛋白含有两个HMG-box结构域.通过实时荧光定量PCR (quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)方法分析了vv-exp基因在草菇不同生长阶段以及不同部位的表达量,结果显示该基因在原基表达量较高,表明此基因可能与草菇子实体的形成有关;另外,在成熟期菌盖中vv-exp表达量比原基上调达到3倍以上,且显著高于伸长期菌盖,由此推断该基因参与调控草菇子实体开伞.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢宝贵	福建农林大学生命科学学院	186	1536	20.0	28.0
2	王威	福建农林大学生命科学学院菌物研究中心	51	204	8.0	11.0
3	严俊杰	福建农林大学生命科学学院菌物研究中心	22	57	4.0	6.0
4	连玲丹	福建农林大学生命科学学院菌物研究中心	4	14	3.0	3.0
5	卢园萍	福建农林大学生命科学学院菌物研究中心	4	11	2.0	3.0
6	谢斌	福建农林大学生命科学学院菌物研究中心	4	9	2.0	3.0
7	郭丽(石羡)	福建农林大学生命科学学院菌物研究中心	4	19	3.0	4.0