西施舌3个群体H2A基因和nad6-nad1片段序列比较研究

• 作者: 孟学平 屠海淼 朱明 朱笑琳 杨婕 申欣
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 西施舌(Coelomactra antiquata) 组蛋白H2A基因 nad6-nad1区域 遗传分化
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 页码范围: 26-32
• 页数: 7页
• 分类号: Q959
• 字数: 5451字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11759/hykx20130803001

摘要

西施舌(Coelomactra antiquata)浮游幼虫EST序列拼接获得组蛋白H2A ORF及其两翼的非编码区,在ORF两翼设计引物Can-H2AF和Can-H2AR,扩增H2A基因片段；从nad63′端和nad15′端设计引物,扩增两基因区域DNA序列,测序并进行核苷酸序列差异分析,研究漳州西施舌分化水平。结果：共获得西施舌3个群体H2A基因606bp或616bp基因区DNA片段23条,检测到9种基因型(Gen)。西施舌漳州群体H2A基因AT含量(51.51%)高于日照、北海群体AT含量(50.58%)；序列比对分析显示,简约信息位点占4.05%。基于 H2A基因的漳州群体与日照/北海混合群体间遗传距离平均为0.044,漳州群体,混合群体内遗传距离分别为0.003和0.004,群体间与群体内遗传距离之比为11~14.7； AMOVA分析结果显示,漳州群体和混合群体间发生了极显著遗传分化(FST=0.937, P<0.01)。从nad6~nad1片段中共检出7种单倍型(Hap),漳州群体与日照群体无共享单倍型,基于nad6~nad1的漳州群体与日照群体间遗传距离为0.199~0.202,群体间与群体内遗传距离之比50~66,两个群体间nad1多肽链一级结构存在极大差异,有9个位点的氨基酸不同,日照西施舌缺失6个氨基酸。线粒体DNA显示西施舌漳州与日照群体发生了明显的遗传分化。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	申欣	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物产业技术协同创新中心	37	175	8.0	11.0
2	孟学平		46	339	11.0	15.0
3	朱明	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物产业技术协同创新中心	45	363	10.0	18.0
4	朱笑琳	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物产业技术协同创新中心	1	0	0.0	0.0
5	屠海淼	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物产业技术协同创新中心	1	0	0.0	0.0
6	杨婕	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物产业技术协同创新中心	1	0	0.0	0.0