三种裸腹溞的16S rDNA序列分析与系统分类探讨

• 作者: 张海军 徐敏 晁秋杰 王文平 邓道贵
• 来源期刊: 湖泊科学
• 关键词: 裸腹溞 16S rDNA 系统分类
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 305-310
• 页数: 6页
• 字数: 4220字
• 语种: 中文

摘要

为了检验已记录的3种裸腹溞(发头裸腹溞(Moina irrasa)、短型裸腹溞(Moina brachiata)、微型裸腹溞(Moina micrura))的系统分类,用试剂盒法分别提取3种裸腹溞的基因组DNA.利用特异性引物,通过PCR扩增了3种裸腹溞的16S rDNA部分序列,并与来自GenBank中每个种类相似度较高的裸腹溞属序列进行分析.结果表明,3种裸腹溞的平均种间相似度为88.7％,碱基中A+T含量均明显高于G+C含量.本研究的发头裸腹溞的16S rDNA序列与GenBank所下载的多刺裸腹溞(Moina macrocopa)的16S rDNA序列相似度为99％,遗传距离(K2P双参考模型)为0.5％,属种内范围;两个地区的短型裸腹溞测得的16S rDNA序列与GenBank下载的欧洲短型裸腹溞的16S rDNA序列序列相似度相对较低(88％～90％),遗传距离较大(13.2％ ～ 13.5％左右),已达到属内种间分化水平.基于16S rDNA构建的NJ树和贝叶斯树也支持以上结论.结果表明,本研究的发头裸腹溞可能为多刺裸腹溞,本研究用的短型裸腹溞与GenBank下载的欧洲短型裸腹溞已经达到种间分化的标准.由于缺乏物种形态资料和其他分子标记的对比,3种裸腹溞的分类地位还需进行更深入的探讨.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓道贵	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	46	242	9.0	14.0
2	徐敏	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	4	5	2.0	2.0
3	张海军	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	25	77	5.0	7.0
4	王文平	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	3	3	1.0	1.0
5	晁秋杰	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	4	6	1.0	2.0