三疣梭子蟹几丁质酶基因的克隆及其在蜕皮过程中的表达分析

• 作者: 侯文杰 吴旭干 成永旭 潘桂平 王伟
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 三疣梭子蟹 几丁质酶 基因克隆 表达分析 蜕皮周期
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 页码范围: 1291-1301
• 分类号: Q785|S968
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20141209608

摘要

为探究几丁质酶基因在三疣梭子蟹蜕皮过程中的生理作用,本研究通过转录组测序和RACE技术克隆了三疣梭子蟹几丁质酶基因(PtChi)cDNA全长(登录号:KF914663),并通过荧光定量PCR(qRT-PCR)技术研究了该基因在三疣梭子蟹不同组织及不同蜕皮阶段的表达情况.结果表明:(1) PtChi基因cDNA全长2 200 bp,包括5'非编码区(5'-UTR)16 bp、3 '非编码区(3 '-UTR)714 bp和开放阅读框1 470 bp,编码489个氨基酸,预测蛋白质分子量和等电点为53.97 ku和4.76.(2)BlastP结果显示,PtChi推导氨基酸序列与已知甲壳动物Chi-3的一致性为61％ ～96％,系统进化树分析表明PtChi与其他甲壳动物Chi-3聚为一支.(3)qRT-PCR结果显示PtChi基因在C期三疣梭子蟹肝胰腺中表达水平最高,胃、大颚器、心脏和眼柄中PtChi-mRNA表达水平依次降低,在其他组织中PtChi-mRNA表达量最低,且表达水平无显著差异.(4)不同蜕皮阶段,PtChi在肝胰腺、肠、胃和大颚器4种组织中的表达变化模式有所不同,肝胰腺中PtChi-mRNA表达水平在AB期最高,C期最低,暗示PtChi可能参与三疣梭子蟹蜕皮后期对病原体的免疫防御;肠中的PtChi-mRNA表达水平在E期最高,C期最低,推测PtChi参与蜕皮过程中肠道围食膜的分解和免疫功能;胃中PtChi表达水平在C期最高,暗示其参与了食物消化.以上结果表明,本研究克隆的PtChi可能为甲壳动物Chi-3型,其准确生理学功能及其在蜕皮过程中的调控机制有待进一步深入研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	成永旭	上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	75	457	11.0	17.0
5	吴旭干	上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	65	396	10.0	16.0
6	王伟	上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	11	84	4.0	9.0
10	潘桂平	中国水产科学研究院东海水产研究所	1	8	1.0	1.0
11	侯文杰	中国水产科学研究院东海水产研究所	1	8	1.0	1.0