NAC家族生物信息学分析

• 作者: 吕楠 朱乾坤 朱梦丽 王万军 邹嘉欣
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: NAC NAM结构域 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 68-73
• 页数: 6页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 2593字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2015.01.013

摘要

目的:探讨NAC基因结构和分布特点,了解NAC基因之间的进化关系.方法:从NCBI下载获得目标序列,通过染色体定位、比对、拼接得到新的mRNA,翻译为蛋白质,得到保守基序,再比对,绘制系统发育树进行分析.结果:生物信息学分析发现NAC家族基因在5个物种的基因组中都有分布;大多数NAC基因都有3个以上的外显子,绝大多数NAC基因仅1个NAM结构域,大多数NAM结构域都具有两端的保守基序,大多数NAM结构域位于2个相邻外显子上;NAC蛋白在单、双子叶植物分化上已有功能上的分歧.结论:NAC家族基因分布广,结构多为3个外显子,1个拥有两端保守基序的NAM结构域位于2个相邻外显子上.该研究为鉴定并获得NAC全长序列奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王万军	西南交通大学生命科学与工程学院植物组织培养实验室	38	153	7.0	10.0
2	邹嘉欣	西南交通大学生命科学与工程学院植物组织培养实验室	4	15	3.0	3.0
3	吕楠	西南交通大学生命科学与工程学院植物组织培养实验室	4	15	3.0	3.0
4	朱梦丽	西南交通大学生命科学与工程学院植物组织培养实验室	3	9	2.0	3.0
5	朱乾坤	西南交通大学生命科学与工程学院植物组织培养实验室	6	29	2.0	5.0