斑马鱼过氧化物还原酶的生物信息学分析

• 作者: 孙晶 薛壮
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑马鱼 过氧化物还原酶 生物信息学 结构和功能
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 36-41
• 页数: 6页
• 分类号: Q518
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2015.01.007

摘要

[目的]利用生物信息学方法分析斑马鱼过氧化物还原酶Peroxiredoxin (Prx)家族的结构和功能.[方法]基于NCBI数据库中的BLAST程序,搜索斑马鱼Prx序列,从蛋白质氨基酸序列比对、系统发育、信号肽、跨膜区、二级结构、高级结构及蛋白质相互作用等方面进行解析.[结果]斑马鱼Prx家族有6个成员(Prx1-Prx6),均含有抗氧化活性半胱氨酸Cys,不含有跨膜结构域,仅Prx4含有信号肽.Prx1-Prx4.序列同源性大于50％,有共同的祖先.Prx1-Prx5可与硫氧还蛋白相互作用,Prx6可与谷胱甘肽相互作用.脯氨酸、苏氨酸和精氨酸在空间结构上与斑马鱼Prx活性半胱氨酸接近,有利于Prx抗氧化活性发挥.[结论]斑马鱼Prx蛋白结构具有脊椎动物Prx特点,具有潜在的抗氧化生物学活性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙晶		10	22	3.0	4.0
2	薛壮		3	3	1.0	1.0