陆地棉耐盐性状与SSR分子标记的关联分析

• 作者: 叶武威 桑晓慧 王俊娟 王红梅 赵云雷 邵冰欣 郭志军 陈伟 龚海燕
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 关联分析 SSR分子标记 耐盐性
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 118-125
• 页数: 8页
• 分类号: S562.035
• 字数: 4138字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201502004

摘要

本研究以134份陆地棉栽培种为试验材料,测定其在0.3％盐浓度(质量分数)下的出苗率,并使用74对SSR引物对这些材料进行基因组变异扫描.利用Structure2.3.4软件分析该自然群体的遗传结构,在此基础上采用Tassel2.1软件对耐盐性状与SSR分子标记进行关联分析,寻找与棉花耐盐性状相关的分子标记.研究结果表明:(1)134份陆地棉栽培种的出苗率呈极显著差异,并筛选出27个盐敏感材料和10个耐盐材料.(2)74个SSR分子标记共检测出148个多态性位点,涉及246个等位变异,变异范围为2～7,平均每个标记3.32个;基因多样性指数变异范围为0.0295～0.4959,平均值为0.2897; SSR分子标记多态性信息含量(PIC)变幅为0.0290～0.3729,平均值为0.2381.(3)通过群体结构分析,将该自然群体划分2个亚群体,分别包含89份和45份材料.(4)关联分析共发现8个与棉花耐盐性状相关的SSR分子标记位点,表型变异解释率变幅为2.91％～7.82％,平均值为4.32％.此研究结果可以为棉花耐盐性状分子标记辅助选择育种提供参考.