太平洋鳕IRF3基因的克隆及绝对定量表达分析

• 作者: 姜志强 孙航 暴宁 李幸 毛明光 温施慧 苏鹏 蒋洁兰
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 太平洋鳕 IRF3 干扰素 绝对定量PCR
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 887-895
• 页数: 9页
• 分类号: S917
• 字数: 5967字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2015.15049

摘要

本研究通过克隆首次得到太平洋鳕(Gadus macrocephalus)干扰素调节因子3(interferon regulatory factor 3, IRF3)的部分序列。该序列长1878 bp,包含长1377 bp的完整开放阅读框(open reading frame, ORF),编码459个氨基酸,其编码的蛋白质分子量约为51 kD。经氨基酸序列比对发现,太平洋鳕 IRF3的氨基酸序列包括1个含有5个保守色氨酸残基的DNA结合域(DNA binding domain, DBD)和1个保守的C端IRF关联域(IRF association domain, IAD)；系统进化树分析表明,太平洋鳕IRF3与其他物种的IRF3亲缘关系较近。应用绝对荧光定量PCR方法对IRF3在不同组织和不同日龄(days post-hatching, dph)仔鱼的表达水平进行检测,并对干扰素在仔鱼期的免疫作用进行分析。组织表达绝对定量结果显示,性腺,肝和胸腺表达量高于其他组织。不同日龄仔鱼IRF3表达量结果显示, IRF3在受精卵就已经表达,在25 dph表达量大幅提高。本研究的结果为进一步研究太平洋鳕干扰素作用机制以及其在早期发育中的作用奠定了基础。