河南省柯萨奇病毒A组16型VP4基因特征分析

• 作者: 卫海燕 王海霞 许玉玲 陈豪敏 黄学勇
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒A组16型 VP4 进化树
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 40-44
• 页数: 5页
• 分类号: R189
• 语种: 中文

摘要

目的 分析河南省手足口病标本分离柯萨奇病毒A组16型(coxsachievirus A 16,CVA16) VP4的基因特征,并比较VP4与VP1遗传进化分析的差异.方法 对分离自河南省手足口病(hand-foot-mouthdisease,HFMD)患儿的8株CVA16,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法进行VP4区域扩增并对扩增产物进行测序,用分子生物学软件ATGC进行序列拼接,Bioedit比对剪齐,用MEGA 4.0软件进行同源性分析,并与已报道的CVA16标准株序列构建基因进化树.结果 河南省8株毒株VP4核苷酸同源性为91.3％～98.1％、氨基酸同源性为100.0％,与国际原型株CA16/G10/RSA/1951(A型)比对,VP4核苷酸同源性为79.7％～82.6％,氨基酸同源性为100.0％;与B1a、B1b和B2型代表株核苷酸同源性分别为92.3％～95.7％、92.8％～98.6％、88.9％～91.8％,氨基酸同源性均为100.0％.河南省分离的CVA16毒株均属于B1亚型,有B1a和B1b两个进化支共同存在和循环,但VP4与VP1的进化树分型不完全一致.结论 VP4基因不能作为CVA16病毒基因亚型分型的依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈豪敏	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	58	514	12.0	18.0
2	黄学勇	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	93	505	10.0	17.0
3	许玉玲	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	23	38	4.0	5.0
4	王海霞	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	5	1	1.0	1.0
5	卫海燕	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	20	62	5.0	7.0