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云南虫生真菌粉棒束孢遗传分化研究
云南虫生真菌粉棒束孢遗传分化研究
作者:
代永东
杨俊媛
虞泓
陈自宏
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
ITS序列分析
RAPD扩增分析
单倍型
居群扩张
相关性
摘要:
对云南粉棒束孢8个当地居群和蝙蝠蛾拟青霉2个当地居群进行ITS测序和RAPD扩增分析,结合GenBank中相关序列,对粉棒束孢开展遗传多样性、居群遗传结构及其种内分化研究.共获得大范围内地理距离远的6个居群共97条粉棒束孢ITS序列,共有33种单倍型,单倍型多样性Hd=0.546和总核苷酸多样性Pi=0.00276,显示粉棒束孢在物种水平上遗传多样性较低.云南粉捧束孢共37条序列,有14种单倍型(10种为云南特有),具有较高单倍型多样性和核苷酸多样性(Hd=0.659,Pi=0.00274);单倍型聚类和网状分支分析表明云南粉棒束孢单倍型类型丰富,遗传多样性高,暗示云南为粉棒束孢多样性分布中心之一.ITS序列分析表明,云南当地居群间遗传分化系数Fst氏=51.95%; RAPD分析表明,居群间遗传分化系数Gst=0.5547,基因流Nm=0.4014;说明云南当地居群粉棒束孢分化剧烈.居群遗传距离与地理距离相关性研究表明,粉棒束孢居群遗传距离与地理距离无明显相关.中性检验和失配分析表明粉棒束孢经历过近期居群扩张.结合单倍型聚类和网状分支分析,表明Hap 19为扩张建群单倍型,但原始祖先单倍型(Hap 1)依然是粉棒束孢居群中最优势单倍型(频率为48.45%),表明粉棒束孢并不存在明显的因地理原因造成的生殖隔离.值得重视的是,通过ITS单倍型和RAPD分析,支持将蝙蝠蛾拟青霉作为粉棒束孢异名处理.
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来源期刊
菌物学报
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关键词
ITS序列分析
RAPD扩增分析
单倍型
居群扩张
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年,卷(期)
2015,(1)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
38-52
页数
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13346/j.mycosystema.130198
五维指标
作者信息
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1
虞泓
云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室
91
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2
陈自宏
云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室
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杨俊媛
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代永东
云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室
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研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
菌物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国菌物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-6472
CN:
11-5180/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
2-499
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3221
总下载数(次)
8
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