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摘要:
对云南粉棒束孢8个当地居群和蝙蝠蛾拟青霉2个当地居群进行ITS测序和RAPD扩增分析,结合GenBank中相关序列,对粉棒束孢开展遗传多样性、居群遗传结构及其种内分化研究.共获得大范围内地理距离远的6个居群共97条粉棒束孢ITS序列,共有33种单倍型,单倍型多样性Hd=0.546和总核苷酸多样性Pi=0.00276,显示粉棒束孢在物种水平上遗传多样性较低.云南粉捧束孢共37条序列,有14种单倍型(10种为云南特有),具有较高单倍型多样性和核苷酸多样性(Hd=0.659,Pi=0.00274);单倍型聚类和网状分支分析表明云南粉棒束孢单倍型类型丰富,遗传多样性高,暗示云南为粉棒束孢多样性分布中心之一.ITS序列分析表明,云南当地居群间遗传分化系数Fst氏=51.95%; RAPD分析表明,居群间遗传分化系数Gst=0.5547,基因流Nm=0.4014;说明云南当地居群粉棒束孢分化剧烈.居群遗传距离与地理距离相关性研究表明,粉棒束孢居群遗传距离与地理距离无明显相关.中性检验和失配分析表明粉棒束孢经历过近期居群扩张.结合单倍型聚类和网状分支分析,表明Hap 19为扩张建群单倍型,但原始祖先单倍型(Hap 1)依然是粉棒束孢居群中最优势单倍型(频率为48.45%),表明粉棒束孢并不存在明显的因地理原因造成的生殖隔离.值得重视的是,通过ITS单倍型和RAPD分析,支持将蝙蝠蛾拟青霉作为粉棒束孢异名处理.
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文献信息
篇名 云南虫生真菌粉棒束孢遗传分化研究
来源期刊 菌物学报 学科
关键词 ITS序列分析 RAPD扩增分析 单倍型 居群扩张 相关性
年,卷(期) 2015,(1) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 38-52
页数 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13346/j.mycosystema.130198
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 虞泓 云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室 91 1342 22.0 32.0
2 陈自宏 云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室 9 45 5.0 6.0
3 杨俊媛 云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室 7 41 5.0 6.0
4 代永东 云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室 7 31 4.0 5.0
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RAPD扩增分析
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菌物学报
月刊
1672-6472
11-5180/Q
16开
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
2-499
1982
chi
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