PCR-DGGE技术解析东北稻田蓝藻群落结构

• 作者: 刘俊杰 曹焜 王光华 荆瑞勇 郭永霞
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 农学
• 关键词: 稻田 蓝藻 多样性 PCR-DGGE 16S rRNA基因
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 155-160,172
• 页数: 7页
• 分类号: S182|Q938
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2015.02.032

摘要

[目的]明确东北稻田生态系统蓝藻群落结构组成变化及主要驱动因子.[方法]采用蓝藻特异性引物GC-Cya-b-F371和Cya-R783对采自东北不同土壤类型稻田土壤及田面水提取的DNA进行PCR扩增,采用DGGE电泳和条带测序技术解析稻田蓝藻群落结构.[结果]多样性指数表明,土壤中蓝藻群落结构比田面水体丰富.图谱冗余分析(RDA)显示,稻田土壤中蓝藻群落结构具有明显的地域差异,土壤碳氮比值是驱动土壤蓝藻分布的主要环境因素;而田面水体蓝藻群落结构地域差异不明显,pH值是驱动水体蓝藻分布的主要环境因素.DGGE条带测序发现,稻田蓝藻群落结构组成以丝状颤藻亚纲蓝藻(Oscillatoriophycideae)为主,一些条带基因序列与已知蓝藻相似度低于97％.[结论]东北稻田生态系统蓝藻群落结构复杂多样,生存着一些未知的蓝藻种群.