东北野生大豆核心种质单核苷酸多样性分析

• 作者: 刘晓冬 孟爽 尹光 李建东 王玉民 董英山 袁翠平 赵洪锟
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 野生大豆 核心种质 SNP Indel 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 185-190
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2015.02.0185

摘要

对196个东北野生大豆核心种质的NRT2、AspAT2和CPK13三个基因片段进行单核苷酸扫描,共检测到94个SNPs位点及10个插入/缺失位点(Indel),碱基转换和颠换平均比例约2∶1.稀有SNPs位点(＜10％)39个,比率约为41.5％.196份核心种质平均多态性位点比例约为74％,Shannon's指数是0.366,多样性指数为0.241;不同纬度群体的平均多样性指数随纬度下降逐渐升高,在44°N时达到峰值,然后随纬度降低缓慢下降,多样性指数变化呈近似正态曲线模式.初步推测N 42°～N45°区域为东北野生大豆的多样性中心.