高通量RNA甲基化测序数据处理与分析研究进展

• 作者: 刘恋 孟佳 张绍武 陈润生
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 关键词: MeRIP-seq测序 数据处理与分析 RNA甲基化 表观遗传
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 综述与专论
• 页码范围: 891-899
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16476/j.pibb.2015.0078

摘要

随着高通量测序技术快速发展,MeRIP-seq (methylated RNA immunoprecipitation sequencing)测序技术开启了RNA表观遗传学研究新局面,能够在全基因组范围内描述RNA甲基化.从MeRIP-seq高通量数据中挖掘RNA甲基化模式,有助于揭示mRNA甲基化在调控基因表达、剪切等方面所发挥的潜在功能,有效指导癌症的干预治疗.本文从MeRIP-seq测序原理出发,较全面地综述MeRIP-seq数据处理和分析方法研究现状,并对其所面临的计算问题进行讨论和展望.