蒺藜苜蓿全基因组中 U-box 基因家族的筛选与特征分析

• 作者: 李聪 邵麟惠 郑兴卫
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 蒺藜苜蓿 U-box 基因家族 进化 表达模式
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 130-141
• 页数: 12页
• 字数: 6590字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2015102

摘要

植物基因组中广泛存在 U-box 基因，其编码蛋白大部分作为泛素系统中决定底物特异性识别的 E3泛素连接酶，广泛地调控植物生长生殖发育以及响应逆境胁迫等过程。本文利用蒺藜苜蓿基因组数据库，通过生物信息学手段，鉴定蒺藜苜蓿 U-box 家族基因；采用 MEGA6软件进行系统进化树分析；通过 GSDS 在线工具和 Mapinspect软件进行基因结构及染色体定位分析；利用已有的蒺藜苜蓿芯片数据进行组织表达和胁迫响应表达分析。结果表明，蒺藜苜蓿基因组中含有41个 U-box 基因，不均匀地分布于蒺藜苜蓿的8条染色体上。根据结构域组成和系统进化分析将这些 U-box 蛋白分成6类。基因表达模式分析发现，该家族成员的表达具有一定的组织特异性，并能响应盐、干旱和氮素胁迫。这些研究结果为蒺藜苜蓿 U-box 基因家族的功能分析奠定了基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李聪	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	45	378	11.0	17.0
2	邵麟惠	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	6	24	3.0	4.0
3	郑兴卫	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	6	28	3.0	5.0