特异长链非编码RNA在鼻咽癌中的表达及其意义

• 作者: 杨青青 邓燕飞
• 来源期刊: 肿瘤防治研究
• 学科: 医学
• 关键词: 鼻咽癌 长链非编码RNA 长链非编码RNA芯片
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 219-224
• 分类号: R739.63
• 语种: 中文
• DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2015.03.002

摘要

目的 分析长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在鼻咽癌与慢性鼻咽炎组织中表达水平的变化,寻找可能与鼻咽癌发生发展相关的特异lncRNA.方法 采用lncRNA芯片技术分析lncRNA和mRNA在鼻咽癌与慢性鼻咽炎组织的表达谱,筛选差异表达的lncRNA和mRNA,进一步研究使用了聚类分析、GO分析、pathway分析等生物信息学技术.结果 差异表达的lncRNA(2倍以上变化且P＜0.05)共856条,其中上调的共425条,下调的共431条;差异表达的mRNA共767条,其中上调的共426条,下调的共341条.利用聚类分析方法将差异表达的lncRNA分成3类:增强子型lncRNA、HOX基因簇、基因间lncRNA.GO分析将mRNA分成3类:生物学过程类、细胞组分类、分子功能类.Pathway分析显示mRNA共参与28条信号通路,其中参与细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路的上调差异表达的mRNA的富集度最高.结论 与慢性鼻咽炎相比,lncRNA在鼻咽癌组织的表达水平明显改变,提示差异表达的lncRNA可能与鼻咽癌的发生发展有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨青青	福建医科大学协和临床医学院	1	1	1.0	1.0