烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因家族的全基因组鉴定

• 作者: 夏玉珍 李泽锋 李锋 杨军 林福呈 武明珠 王中 王燃 罗朝鹏 金立锋 魏攀
• 来源期刊: 烟草科技
• 学科: 工学
• 关键词: 普通烟草 林烟草 绒毛状烟草 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS) 基因家族 全基因组
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 烟草农学
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: TS413
• 字数: 4560字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16135/j.issn1002-0861.20150601

摘要

为了揭示烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶（Geranylgeranyl pyrophosphate synthase， GGPPS）基因家族的特征和功能，利用生物信息学方法对烟草GGPPS家族进行了全基因组查找、鉴定及相关分析。在普通烟草中共鉴定出9个成员（大亚基7个、小亚基2个），林烟草、绒毛状烟草中分别鉴定出5个成员（大亚基4个、小亚基1个）。GGPPS的开放阅读框长度为999~1119 bp，编码332~372个氨基酸，蛋白质分子量为36.2~40.7 kD，等电点为5.41~8.32。大亚基和小亚基基因分别含有1个和2个外显子；大亚基与小亚基均具有DD（XX）1-2D和CXXXC保守性基序，但存在一定的差异。在进化过程中，烟草GGPPS家族可能发生了串联重复复制和片断复制；普通烟草GGPPS家族可能发生了基因丢失，NtabGGPPS1-1和NtabGGPPS1-2较其他成员进化速率快，同时可能受到了净化选择。