丹参柯巴基焦磷酸合酶的生物信息学分析

• 作者: 张磊 李卿 邸鹏 陆文铨 陈万生
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 丹参 柯巴基焦磷酸合酶(CPS) 生物信息学 一级结构 二级结构 三级结构
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 887-894
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2015.06.020

摘要

目的 分析丹参柯巴基焦磷酸合酶(CPS)的氨基酸序列特征,并与其他植物进行比较,为丹参CPS蛋白的后续研究提供有利参考.方法 利用生物信息学方法,以丹参为主,对13科16种植物的18条CPS蛋白序列进行了序列组成、生化特性、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级、三级结构及功能域等预测分析,并进行了丹参CPS蛋白序列与其他植物的同源比对以及系统进化树构建.结果 CPS蛋白氨基酸残基数集中在730以上;相对分子质量91 610左右;平均理论等电点5.87,提示CPS为酸性蛋白.序列结构预测结果显示,CPS蛋白具有明显的疏水区和亲水区,不存在信号肽,不具有跨膜结构域,可能有叶绿体转运肽.蛋白质二级结构中最主要的结构元件是α-螺旋和无规则卷曲.蛋白同源性比对结果显示,丹参CPS与同科植物迷迭香和玄参科植物野甘草的同源性最高.结论 对丹参等植物的CPS蛋白进行了详细的生物信息学分析,可为今后深入研究该酶的结构特征和功能提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张磊	中国人民解放军第二军医大学药学院药用植物学教研室	277	1260	15.0	26.0
2	陈万生	中国人民解放军第二军医大学附属长征医院药学部	13	127	7.0	11.0
3	李卿	中国人民解放军第二军医大学附属长征医院药学部	5	13	1.0	3.0
4	陆文铨	中国人民解放军第二军医大学附属长征医院药学部	5	23	2.0	4.0
5	邸鹏	中国人民解放军第二军医大学附属长征医院药学部	1	12	1.0	1.0