衣原体噬菌体衣壳蛋白3的结构、免疫原性及临床价值研究

• 作者: 卢桂玲 姚卫锋 宋蒙蒙 张理涛 李宜儒 李群燕 王磊 袁静
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 微病毒属 衣原体科 蛋白质类 生物信息学 结构 免疫
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 420-424
• 页数: 5页
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文

摘要

分析衣原体微病毒Vp3蛋白在分子重组、分子进化及病毒野生株筛查的作用并挖掘生物信息,揭示其临床研究价值.以ProteinBlast的Multriple alignment程序比对各株衣原体微病毒衣壳蛋白Vp3序列;以Distance tree(ProteinBlast)程序完成种系发生树.以比对获得的高保守区的氨基酸序列为目标,应用Karplus-schu1z法进行柔性区域分析;通过Gamier-robson法和Chou-fasman法分析该序列的二级结构;使用Emini法完成表位的表面可及性分析,并用Kyte-Doolittle法和Hopp-woods法完成蛋白亲水性研究;应用Jameson-WoH法完成表位的抗原指数分析.6株衣原体微病毒Vp3蛋白序列高度保守,差异主要在Chp1与其他5株微病毒的Vp3蛋白之间.各株微病毒的Vp3蛋白均有以a螺旋为主的结构,蛋白序列高保守区存在多个细胞表位.Vp3蛋白结构性质保守,也是衣原体噬菌体衣壳的重要组分.其蛋白分子结构复杂,高保守区有较强的免疫原性,在分子重组、沙眼衣原体微病毒野生株筛查研究中有实际研究价值.