玉米CDK抑制子ICK基因家族的生物信息学分析

• 作者: 徐辰武 杜灿灿 杨泽峰 高清松
• 来源期刊: 扬州大学学报（农业与生命科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 ICK基因 基因家族 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 页码范围: 47-53,78
• 页数: 8页
• 分类号: S513
• 语种: 中文

摘要

采用生物信息学方法对玉米基因组中的细胞周期蛋白依赖的激酶(CDK)抑制子(ICK)基因进行了全面鉴定,并对其基因结构、蛋白质保守序列和基因表达情况进行了分析.结果表明:玉米基因组中含有9个ICK基因,片段复制是玉米ICK基因家族数目扩增的主要动力.玉米ICK基因的外显子数为2～4个不等,同一亚族基因的外显子/内含子结构具有一定保守性.蛋白质保守序列分析鉴定出6个保守的基序,这些基序与ICK蛋白的核定位、功能和稳定性调节以及对CDK活性的抑制相关,说明玉米ICK蛋白可能是有功能的CDK抑制子.基于基因芯片和EST数据的表达模式分析表明,多数玉米ICK基因在各组织器官中均有表达,部分基因的表达具有一定的组织特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐辰武		66	988	18.0	29.0
2	高清松		3	32	2.0	3.0
3	杨泽峰		21	111	6.0	10.0
4	杜灿灿		1	0	0.0	0.0